بررسی خصوصیات چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی در ناحیه َ5 ژن لاکتوفرین در گاوهای بومی و هلشتاین ایران

زمینه مطالعه: لاکتوفرین، گلیکوپروتیین متصل شونده به آهن، دارای نقش‌های فیزیولوژیکی متعددی می باشد که مهمترین آنها خواص آنتی میکروبی است. از این رو ژن کد کننده این پروتیین می تواند به عنوان ژن کاندیدایی در مقاومت به بیماری ورم پستان در نظر گرفته شود. هدف: بررسی ناحیه َ5 ژن لاکتوفرین گاو در نمونه‌های بومی و هلشتاین با استفاده از روش ‌PCR-SSCP‌ و تعیین توالی می باشد. روش کار: برای این منظور از تعداد 50 نمونه گاو بومی و 50 نمونه گاو هلشتاین ماده ژنتیکی استخراج گردید. آغازگرهای لازم جهت تکثیر بخشی از ناحیه َ5 ‌طراحی، و قطعه مورد نظر توسط روش SSCP تعیین ژنوتیپ شد. سپس هر الگوی مشاهده شده تعیین توالی گردید و همترازی توالی‌ها جهت شناسایی چند شکلی‌های تک نـوکلئـوتیـدی صـورت گـرفت. همچنین، تجزیه و تحلیل این سیلیکو‌(In silico)‌ جهت تأثیر چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی برجایگاه اتصال فاکتورهای رونویسی در ناحیه تکثیر شده صورت گرفت. نتایج:‌ ‌در این تحقیق، در تمام نمونه‌های مورد بررسی 3 الگوی واضح ) SSCP‌A، B و (C‌ برای قطعه تکثیر شده مشاهده شد که در گاو‌های بومی تنها‌هاپلوتیپ ‌C‌ آشکار گردید. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی‌ها نشان داد که جایگزینی ‌T‌ با ‌G‌ در جایگاه 602 منجر به ایجاد جایگاه اتصالی برای فاکتور رونویسی ‌1AML-‌ گردید. از طرف دیگر، جایگزینی ‌T‌ با ‌C‌ در جایگاه 586 جایگاه اتصال فاکتور رونویسی 1AML-‌ را منسوخ می کند. نتیجه گیری نهایی: بنابراین، جهت استفاده از ژن لاکتوفرین به عنوان نشانگر مقاومت به بیماری ورم پستان در گاوهای شیری، بررسی این چند شکلی‌ها از نظر تأثیر بر فرآیند رونویسی ژن، همچنین ارتباط آن با تعداد سلول‌های سوماتیکی شیر امری ضروری می باشد.